请问:我持有两次申根签证,先入境匈牙利,然后自驾进入克罗地亚,再穿过波黑前往克罗地亚的杜布罗夫尼克,最后回到匈牙利,签证上面没问题吧?进入克罗地亚并不扣除申根签证的次数对吗?

应该不能,两次申根坐飞机的话,只能从奥地利进入克罗地亚,然后就不能再回到欧盟国匈牙利了,只能从杜布罗夫尼克回国。因为克罗地亚不属于欧盟。你从中国进入奥地利已经用掉一次申根,进入不属于欧盟国的克罗地亚再用掉一次申根,所以就不能回到欧盟国家匈牙利了。自驾的话应该也一样进不了吧。 应该不能,两次申根坐飞机的话,只能从匈牙利进入克罗地亚,然后就不能再回到欧盟国匈牙利了,只能从杜布罗夫尼克回国。因为克罗地亚不属于欧盟。你从中国进入匈牙利已经用掉一次申根,进入不属于欧盟国的克罗地亚再用掉一次申根,所以就不能回到欧盟国家匈牙利了。自驾的话应该也一样进不了吧

计划匈牙利奥地利租车,请建议下是匈牙利租奥地利还?还是分别在两个国家单独分开租?

这两个国家均可,建议在一个国家租车,匈牙利租车去奥地利车型应该没有限制,奥地利租车去匈牙利可能部分高端车型不允许进入匈牙利,建议问租车公司