请教一下美国内陆航班机票的问题

大家好,小弟10月要去美国,现在在计划行程因为要搭乘美国的内陆航班,所以在http://www.expedia.com选机票我发现一个很有趣的事情,比如说我打算从Boston去San Francisco往返的话如果我直接买Boston去San Francisco的往返航班会比我买Boston去LA的往返航班但是从San Francisco中转要贵的多中转航班Boston...

如果我不是往返票,但是一次买的多段行程,好像说第一段是从boston 到LA,然后SF转 From America Airline然后是San Diego 到 NYC, phliy转 From united airline但是是从expedia同一张订单里面打出来的,这样如果我从SF下机的话,后面的San Diego 到 NYC会被取消吗这种都是nonrefund的机票,难道说如果前一趟航班误点了,或者自身原因误机了就只能再找同一家航空公司补高价票,不然买其他航空公司的票去目的地就会被判定为Hidden City Fare不是很无辜的说???